В начале 1840 года Герцен вернулся в Москву, а в мае переехал в Петербург, где по настоянию отца поступил на службу в канцелярию министерства внутренних дел. В 1840 году было перлюстрировано письмо Герцена, в котором он резко отзывался о полиции.

В 1837 году Вятку посетил наследник престола, будущий император Александр II, которого сопровождал его наставник, поэт В.А.Жуковский. За устройство выставки местных произведений и объяснения, данные при её осмотре наследнику престола, Герцен, по ходатайству Жуковского, в конце 1837 года был переведён на службу советником правления во Владимир, где служил в канцелярии губернатора.

Через год после окончания Университета, в 1934 году, все члены кружка Герцена, в том числе он сам и Н.Огарев, были арестованы. Причиною ареста послужил факт существования в Москве вечно о чем-то спорящих, волнующихся и кипятящихся молодых людей, а поводом послужила студенческая вечеринка, на которой якобы распевал песни, порочащие царскую фамилию, и был разбит бюст императора Николая Павловича.